Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX17Q15036 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.8 ms