Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SNX13Q9Y5W8 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNX13Q9Y5W8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.4 ms