Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CENPEQ02224 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.9 ms