Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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COL9A2Q14055 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL9A2Q14055 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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