Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KLF9Q13886 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KLF9Q13886 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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