Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LY6EQ16553 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LY6EQ16553 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.1 ms