Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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LINC00336Q6ZUF6 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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LINC00336Q6ZUF6 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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LINC00336Q6ZUF6 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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LINC00336Q6ZUF6 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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LINC00336Q6ZUF6 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LINC00336Q6ZUF6 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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