Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DDB1Q16531 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.4 ms