Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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