Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
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