Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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SNX13Q9Y5W8 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SNX13Q9Y5W8 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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