Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.9 ms