Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRTO14522 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRTO14522 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.2 ms