Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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