Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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PTPN13Q12923 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTPN13Q12923 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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