Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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COL9A2Q14055 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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COL9A2Q14055 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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COL9A2Q14055 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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COL9A2Q14055 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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COL9A2Q14055 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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COL9A2Q14055 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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COL9A2Q14055 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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COL9A2Q14055 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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