Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNN3Q15417 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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CNN3Q15417 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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CNN3Q15417 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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CNN3Q15417 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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CNN3Q15417 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CNN3Q15417 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CNN3Q15417 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CNN3Q15417 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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