Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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