Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD21O60216 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD21O60216 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD21O60216 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD21O60216 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD21O60216 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD21O60216 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD21O60216 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD21O60216 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms