Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
COL9A2Q14055 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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