Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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