Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIM63Q969Q1 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.7 ms