Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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