Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIM63Q969Q1 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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