Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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PTPN13Q12923 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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