Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCSO14618 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCSO14618 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCSO14618 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCSO14618 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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