Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK3Q13003 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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