Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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FOXD4Q12950 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD4Q12950 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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