Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRTO14522 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRTO14522 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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