Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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