Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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