Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD4Q12950 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms