Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPN13Q12923 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPN13Q12923 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPN13Q12923 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPN13Q12923 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPN13Q12923 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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