Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRTO14522 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.6 ms