Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KLF9Q13886 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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