Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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EXT1Q16394 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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EXT1Q16394 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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EXT1Q16394 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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EXT1Q16394 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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EXT1Q16394 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EXT1Q16394 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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