Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BHMG1C9JSJ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHMG1C9JSJ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms