Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KLF9Q13886 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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