Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
C10orf55Q5SWW7 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.4 ms