Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Edf1Q9JMG1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edf1Q9JMG1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms