Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms