Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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FOXD4Q12950 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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