Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD21O60216 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD21O60216 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD21O60216 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD21O60216 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD21O60216 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD21O60216 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD21O60216 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD21O60216 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD21O60216 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD21O60216 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD21O60216 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD21O60216 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms