Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRTO14522 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.3 ms