Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRTO14522 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRTO14522 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRTO14522 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRTO14522 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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PTPRTO14522 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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