Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRTO14522 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRTO14522 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1226.3 ms