Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PTPN13Q12923 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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