Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms