Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skp2Q9Z0Z3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp2Q9Z0Z3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skp2Q9Z0Z3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms