Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl39Q9JKF7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl39Q9JKF7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.1 ms